我院科研需要，拟公开招标检测项目，要求及参数如下，有意参加竞标者请携带有效证件“营业执照、税务登记证、组织机构代码证、生产厂家证件、授权书（授权单位证件）、法人授权及投标人身份证复印件”等相关证件7天内与设备科联系。 课题招标参数 完成150个样品的宏基因组测序，保证所有样品的不小于_2_ Gb clean data（去接头），并进行相应的生物信息学分析及个性化服务（与文章发表相关的其他个性化分析服务）。
一、建库：
1、粪便样品DNA提取和qubit指控；
2、采用TruSeq DNA Sample Preparation kit和贝克曼库尔特SPRIworks system自动化工作站进行文库制备；
3、对制备后的文库进行的安捷伦2100、Qubit、KAPA qPCR MasterMix and Primer Premix only kit质控。
二、测序：
1、利用illumina/Hiseq 2500 V4 PE125进行测序，保证单个样本不少于2G clean data。
三、信息分析：
1、原始数据去接头、过滤低质量，绘制质量分布图；
2、与同宿主比对，确定样品污染率；
3、要求同时准备定量高丰度和低丰度微生物物种，尤其是低丰度微生物物种；
4、分析Taxonomy profiling和abundance，同时按照界门纲目科属种的顺序不断细化分类结果；
5、物种丰度定量的结果需要经得起16s RNA测序结果的验证；
6、基因功能注释，同KEGG以及eggNOG数据库比对，确定宏基因组的功能；
7、使用归一化后的reads数量，绘制所有样品的相似度；
8、免费提供独立知识产权的正常中国人宏基因组测序数据100份（注，非16S测序数据，数据量大于3G/样本）；
9、高精确地挖掘样本中的致病基因，并获得致病基因的全长序列；同时，获得的全长序列经得起PCR+Sanger测序结果的验证；
10、确定同一物种内的遗传变异，构建分子进化关系，分析进化选择压力；
11、与文章发表相关的一切个性化分析服务。
四、交付周期：
_20_个工作日内完成所有样品的宏基因组测序及信息分析。
联系人：杜老师
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